В горных районах Урала, Средней Азии, Казахстана и Восточной Сибири в формировании подземного стока наблюдается не горизонтальная, а вертикальная зональность. В зависимости от абсолютных отметок рельефа горных сооружений четко отмечается закономерное распределение выпадающих атмосферных осадков - максимальное их количество в высоких частях горных районов и постепенное уменьшение к низкогорьям и прилегающим равнинам.
В горных районах наибольшее влияние на формирование подземного стока оказывают рельефные условия. Здесь отмечается очень глубокое расчленение поверхности горных сооружений: значительные уклоны рек и большая крутизна склонов речных долин. Всё это обуславливает интенсивное дренирование поверхностного и подземного стоков.
По данным Б. И. Куделина, с увеличением абсолютных отметок рельефа в речных долинах повышается значение модуля подземного стока. Так, климатические условия, и в первую очередь количество ежегодно выпадающих атмосферных осадков, а также рельеф строго предопределяют значение модуля подземного стока, а следовательно, величину естественных запасов подземных вод.