Если на площади влияния действующего водозабора могут быть обнаружены техногенные очаги загрязнения поверхностных или подземных вод, то в процессе длительной эксплуатации может ухудшиться качество пресных вод продуктивного горизонта. Произойдет подтягивание к эксплуатационным скважинам контура загрязненных вод и их внедрение в каптажные выработки.
Интенсивный и сосредоточенный отбор подземных вод для целей централизованного водоснабжения нередко может вызвать осушение смежных, залегающих сверху водоносных горизонтов, и, как следствие, привести к изменению ландшафта прилегающей территории, иногда на большой площади.
В этом отношении можно привести интересный пример, описанный Л. С. Язвиным. На северо-восточной окраине г. Минска, в долине р. Слепня вот уже много лет работает водозаборное сооружение «Зеленовка» для обеспечения водой части столицы Белоруссии. В эксплуатации находится здесь слабонапорный межморенный продуктивный горизонт, залегающий на глубинах от 17 до 40 м. С поверхности моренные пески и гравий перекрываются переслаивающимися глинами, песками и суглинками. К этим переслаивающимся слоям приурочен верхний безнапорный водоносный горизонт, залегающий вблизи поверхности и вызывающий в долине рек заболоченность территории.